平面偏振光通過具有旋光活性的介質時，由于介質中同一種旋光活性分子存在手性不同的兩種構型，它們對平面偏振光所分解成的右旋和左旋圓偏振光吸收不同，出射時電場矢量的振幅不同，再次合成的偏振光不是圓偏振光，而是橢圓偏振光，從而產生圓二色性。

圓二色譜儀是用于推斷非對稱分子的構型和構象的一種旋光光譜。光學活性物質對組成平面偏振光的左旋和右旋圓偏振光的吸收系數(ε)是不相等的，εL≠εR，即具有圓二色性。如果以不同波長的平面偏振光的波長λ為橫坐標，以吸收系數之差Δε=εL-εR為縱坐標作圖，得到的圖譜即是圓二色光譜，簡稱CD。如果某手性化合物在紫外可見區域有吸收，就可以得到具有特征的圓二色光譜。由于εL≠εR，透射光不再是平面偏振光，而是橢圓偏振光，摩爾橢圓度[θ]與Δε的關系為：[θ]=3300Δε。圓二色譜也可以摩爾橢圓度為縱坐標，以波長為橫坐標作圖。由于△ε有正值和負值之分，所以圓二色譜也有呈峰的正性圓二色譜和呈谷的負性圓二色譜。在紫外可見光區域測定圓二色譜與旋光譜，其目的是推斷有機化合物的構型和構象。

樣品要求

1、樣品必須保持一定的純度不含光吸收的雜質，溶劑必須在測定波長沒有吸收干擾;樣品能完全溶解在溶劑中, 形成均一透明的溶液。

2、氮氣流量的控制

3、緩沖液、溶劑要求與池子選擇：緩沖液和溶劑在配制溶液前要做單獨的檢查，看是否在測定波長范圍內有吸收干擾， 看是否形成沉淀和膠狀；在蛋白質測量中，經常選擇透明性極好的磷酸鹽作為緩沖體系。

4 樣品濃度與池子選擇

樣品不同，測定的圓二色光譜范圍不同，對池子大小 ( 光徑 ) 的選擇和濃度的要求也不一樣。蛋白質CD光譜測量一般在相對較稀的溶液中進行。